परंपरागत रूप से, भूटान के कई पहाड़ों और घाटियों में गड़गड़ाहट की आवाज़ को ड्रेगन की आवाज़ माना जाता है, और देश को अपनी मूल भाषा में "थंडर ड्रैगन की भूमि" के रूप में जाना जाता है। हालाँकि, झंडे का ड्रैगन डिज़ाइन पड़ोसी चीनी द्वारा सदियों से इस्तेमाल किए गए समान डिज़ाइनों से प्रभावित हो सकता है। अपने पंजों में झंडे पर ड्रैगन को रत्नों के साथ, राष्ट्रीय धन के लिए और पूर्णता के लिए खड़ा किया जाता है। ड्रैगन, जो मूल रूप से हरा था, अब सफेद है, जो पवित्रता का प्रतीक है और देश के भीतर विभिन्न जातीय समूहों की वफादारी है। पीला-नारंगी रंग, जिसे भूटानी सरकार आधिकारिक तौर पर पीले रंग का बताती है, राजा की शक्ति का प्रतीक है, धर्मनिरपेक्ष सरकार के प्रमुख के रूप में, जबकि नारंगी-लाल बाका-भाग्य-पा (काग्य) के साथ जुड़ा हुआ है और रैनिंग-मा-पा (निंगमपा) बौद्ध संप्रदाय और राष्ट्र की धार्मिक प्रतिबद्धता के साथ।
इस ध्वज के परिचय की सही तारीख अज्ञात है, लेकिन यह 1971 में हुआ होगा जब भूटान संयुक्त राष्ट्र में शामिल हुआ था। 1960 के दशक तक भूटान काफी हद तक बाहरी दुनिया के लिए बंद था; इसके विदेशी संबंध यूनाइटेड किंगडम (1910–49) और भारत द्वारा (1949 से 1960 के दशक तक) आयोजित किए गए थे। भूटान के अलगाव और एक समुद्री तट की कमी ने उन परिस्थितियों को सख्ती से सीमित कर दिया जिनके तहत एक राष्ट्रीय ध्वज की आवश्यकता थी।
