सर जॉन पेरोट, (जन्म 1528, हेरोल्डस्टन, पेम्ब्रोकशायर, वेल्स- 3 नवंबर, 1592, लंदन, इंग्लैंड), 1584 से 1588 तक आयरलैंड के स्वामी डिप्टी थे, जिन्होंने दक्षिण-पश्चिमी आयरलैंड में मुंस्टर में एक अंग्रेजी उपनिवेश की स्थापना की।
पेरोट लंबे समय तक इंग्लैंड के राजा हेनरी VIII के नाजायज पुत्र के रूप में प्रतिष्ठित थे, लेकिन उस दावे को समकालीन छात्रवृत्ति में कड़ी चुनौती दी गई है। उनकी माँ मैरी बर्कले थीं, जिनका विवाह जॉन के जन्म के समय पेम्ब्रोकशायर के थॉमस पेरोट से हुआ था। उन्हें 1549 में नाइट किया गया था और 1570 में क्वीन एलिजाबेथ I द्वारा मुंस्टर का अध्यक्ष नियुक्त किया गया था। जेम्स (फिट्ज़मौरिस) फिजराल्ड़ के मुंस्टर विद्रोह को दबाने के बाद, उन्होंने विद्रोहियों को क्षमा कर दिया और इंग्लैंड (1573) लौट आए। 1584 में उन्हें लॉर्ड डिप्टी के रूप में वापस आयरलैंड भेज दिया गया। उन्होंने अंग्रेजी बसने वालों द्वारा वृक्षारोपण के लिए मुंस्टर में विशाल भूमि को जब्त कर लिया, लेकिन उपनिवेश को बुरी तरह से संगठित और निष्पादित किया गया था। हालांकि, वह सफल रहा, लेकिन कनॉट के मूल भूस्वामियों को अंग्रेजी कानून के तहत उन्हें मुकुट का भुगतान करके एक निश्चित धनराशि देनी पड़ी। बदले में, उन्होंने वृक्षारोपण के लिए भूमि खोने से बचा लिया।
इस बीच, रोमन कैथोलिकों के प्रति पेरोट की सहिष्णुता और डबलिन में सेंट पैट्रिक कैथेड्रल को एक विश्वविद्यालय में परिवर्तित करने की उनकी योजना ने उन्हें एडम लॉफ्टस, डबलिन के एंग्लिकन आर्कबिशप की दुश्मनी अर्जित की थी। 1588 में लोफ्टस ने पेरोट को स्पेन के साथ देशद्रोह के आरोपों के आरोपों पर इंग्लैंड को वापस बुला लिया था। पेरोट को दोषी पाया गया था, लेकिन उन्हें मृत्युदंड दिए जाने से पहले जेल में उनकी मृत्यु हो गई।