मेजर हिस्टोकंपैटिबिलिटी कॉम्प्लेक्स (MHC), जीन का समूह जो कोशिकाओं की सतहों पर पाए जाने वाले प्रोटीन के लिए कोड है जो प्रतिरक्षा प्रणाली को विदेशी पदार्थों को पहचानने में मदद करता है। एमएचसी प्रोटीन सभी उच्च कशेरुकियों में पाए जाते हैं। मानव में जटिल को मानव ल्यूकोसाइट एंटीजन (HLA) प्रणाली भी कहा जाता है।
एमएचसी प्रोटीन अणु के दो प्रमुख प्रकार हैं- वर्ग I और वर्ग II। कक्षा I MHC अणु एक जीव में लगभग हर कोशिका की झिल्ली को फैलाते हैं, जबकि कक्षा II के अणु मैक्रोफेज और लिम्फोसाइट्स नामक प्रतिरक्षा प्रणाली की कोशिकाओं तक सीमित होते हैं। मनुष्यों में इन अणुओं को कई जीनों द्वारा कूट-कूट कर भरा जाता है। सभी गुणसूत्र 6 पर एक ही क्षेत्र में होते हैं। प्रत्येक जीन में असामान्य रूप से बड़ी संख्या में जीन होते हैं (एक जीन के वैकल्पिक रूप जो प्रोटीन के वैकल्पिक रूप का उत्पादन करते हैं)। नतीजतन, दो व्यक्तियों के लिए एमएचसी अणुओं का एक ही सेट होना बहुत दुर्लभ है, जिन्हें सामूहिक रूप से ऊतक प्रकार कहा जाता है। एमएचसी में विभिन्न प्रकार के जीन भी शामिल हैं जो अन्य प्रोटीनों के लिए कोड हैं - जैसे कि प्रोटीन, साइटोकिन्स (रासायनिक संदेशवाहक), और एंजाइम- जो वर्ग III एमएचसी अणु कहलाते हैं।
एमएचसी अणु प्रतिरक्षा प्रणाली के महत्वपूर्ण घटक होते हैं क्योंकि वे टी लिम्फोसाइटों को मैक्रोफेज जैसे कोशिकाओं का पता लगाने की अनुमति देते हैं, जो संक्रामक सूक्ष्मजीवों को प्रभावित करते हैं। जब एक मैक्रोफेज एक सूक्ष्मजीव को संलग्न करता है, तो यह आंशिक रूप से इसे पचता है और इसकी सतह पर सूक्ष्म जीव के पेप्टाइड टुकड़े प्रदर्शित करता है, जो एमएचसी अणुओं के लिए बाध्य होता है। टी लिम्फोसाइट एमएचसी अणु से जुड़े विदेशी टुकड़े को पहचानता है और एक प्रतिरक्षा प्रतिक्रिया को उत्तेजित करते हुए इसे बांधता है। असंक्रमित स्वस्थ कोशिकाओं में, एमएचसी अणु अपने स्वयं के सेल (सेल्फ पेप्टाइड्स) से पेप्टाइड्स प्रस्तुत करता है, जिस पर टी सेल सामान्य रूप से प्रतिक्रिया नहीं करते हैं।
एमएचसी अणुओं को शुरू में एंटीजन के रूप में परिभाषित किया गया था जो किसी अंग के प्रतिरोपित अंगों और ऊतकों में प्रतिरक्षा प्रतिक्रिया को प्रोत्साहित करते हैं। 1950 के दशक में चूहों में किए गए स्किन ग्राफ्ट प्रयोगों से पता चला कि ग्राफ्ट रिजेक्शन एक प्रतिरक्षा प्रतिक्रिया थी जो मेजबान जीव द्वारा विदेशी ऊतक के खिलाफ मुहिम शुरू की गई थी। मेजबान ने ग्राफ्ट ऊतक की कोशिकाओं पर एमएचसी अणुओं को विदेशी एंटीजन के रूप में मान्यता दी और उन पर हमला किया। इस प्रकार, एक सफल प्रत्यारोपण में मुख्य चुनौती एक मेजबान और ऊतक प्रकार के साथ एक दाता को खोजने के लिए संभव के रूप में है। शब्द हिस्टोकंपैटिबिलिटी, ग्रीक शब्द हिस्टो (जिसका अर्थ है "टिशू") और अंग्रेजी शब्द संगतता से लिया गया है, एमएचसी अणुओं में प्रत्यारोपण प्रतिक्रियाओं में उनके कार्य का वर्णन करने के लिए लागू किया गया था और उनके वास्तविक शारीरिक कार्य को प्रकट नहीं करता है।