इससे पहले कि 17 फरवरी, 2008 को कोसोवो ने स्वतंत्रता की घोषणा की, इसकी राजनीतिक स्थिति कभी नहीं थी जिसने इसे अपने स्वयं के झंडे की अनुमति दी। द्वितीय विश्व युद्ध के बाद, कोसोवो को सर्बिया गणराज्य के एक स्वायत्त क्षेत्र (बाद में स्वायत्त प्रांत) के रूप में समाजवादी यूगोस्लाविया में शामिल किया गया था। संघीय सरकार ने केवल कई यूगोस्लाव घटक गणराज्यों के लिए झंडे को अधिकृत किया। हालांकि, कोसोवो में रहने वाले जातीय अल्बानियाई को अंततः अल्बानियाई ध्वज को उड़ाने की अनुमति दी गई थी।
1990 के दशक की शुरुआत में समाजवादी यूगोस्लाविया के विघटन के बाद कोसोवो सर्बिया का हिस्सा बना रहा, लेकिन पूरे दशक में प्रांत में अलगाववादी आंदोलन को बल मिला। 1998 में सर्बिया ने कोसोवो में अलगाववादियों के खिलाफ दंडात्मक कार्रवाई की, जो 1999 में उत्तरी अटलांटिक संधि संगठन (नाटो) द्वारा की गई थी। कोसोवो को संयुक्त राष्ट्र प्रशासन के तहत रखा गया था, जो कि कोसोवो की 2008 की स्वतंत्रता की घोषणा के बाद तक बना रहा जब तक कि 2009 में यूरोपीय संघ (ईयू) के अधिकारियों द्वारा बड़े पैमाने पर प्रतिस्थापित नहीं किया गया। सर्बिया और बड़ी संख्या में अन्य देश उस स्वतंत्रता घोषणा के विरोध में बने रहे।
कोसोवो के लिए एक राष्ट्रीय ध्वज का चयन करने के लिए एक औपचारिक प्रतियोगिता आयोजित की गई थी। प्रविष्टियों के एक महान कई सीधे या परोक्ष रूप से अल्बानियाई ध्वज के डिजाइन पर आधारित थे। यूरोपीय संघ के झंडे से प्रभावित पैटर्न ने एक स्पष्ट बयान दिया - कोसोवो को एक बहुराष्ट्रीय देश के रूप में महत्व दिया। यूरोपीय संघ के ध्वज के नीले और पीले रंगों का उपयोग क्रमशः राष्ट्रीय क्षेत्र के ध्वज की पृष्ठभूमि और सिल्हूट के लिए किया जाता था, और कोसोवो के ध्वज पर सफेद सितारों के चाप में सफेद सितारों के यूरोपीय संघ के ध्वज का चक्र समान था। सितारों को देश के छह प्रमुख जातीय समूहों (अल्बानियाई, बोसनीक्स, गोरानी, रोमा, सर्ब और तुर्क) के लिए खड़ा होने के लिए कहा गया था। हालांकि, कोसोवो में जातीय अल्बानियाई और सर्बियाई निवासी अपने-अपने राष्ट्रीय झंडे का इस्तेमाल करते रहे।