19 वीं शताब्दी के अंत में यूरोपीय शक्तियों ने तटीय क्षेत्रों से अंतर्देशीय नियंत्रण बढ़ाने की मांग की, जो उन्होंने पहले मध्य अफ्रीका में जब्त किए थे। बेल्जियम के राजा लियोपोल्ड II के नियंत्रण के तहत, एसोसिएशन इंटरनेशनेल अफ्रीका की स्थापना की गई थी, जिसने 1885 में स्वतंत्र राज्य कांगो (या कांगो मुक्त राज्य) की घोषणा की थी। 1877 से इसका ध्वज, एक सोने के तारे के साथ नीला था जो एक प्रतीक था। "डार्क कॉन्टिनेंट।" संयुक्त राज्य अमेरिका राज्य और उसके ध्वज को पहचानने वाला पहला था। 30 जून, 1960 को इसका उत्तराधिकारी राज्य (बेल्जियम कांगो) एक स्वतंत्र देश बन गया, और छह प्रांतों का प्रतिनिधित्व करने के लिए ध्वज के फहराने के साथ छह पीले तारे जोड़े गए। 1963 में जब प्रांतों की संख्या में परिवर्तन किया गया था, तो पहले ध्वज को पीले रंग की सीमा वाले लाल विकर्ण धारी के साथ बदल दिया गया था, और ऊपरी लहरा कोने में, एक बड़ा पीला सितारा (1966 में ध्वज का डिज़ाइन थोड़ा बदल दिया गया था)।
1971 में राष्ट्रपति मोबुतु सेसे सेको ने देश का नाम बदलकर रिपब्लिक ऑफ़ ज़ैरे रख दिया और एक नया राष्ट्रीय ध्वज बनाया - एक हरे रंग का क्षेत्र जिसमें एक हाथ और एक मशाल के साथ एक पीला डिस्क है। मोबुतु का शासन 1997 में लॉरेंट कबीला के नेतृत्व में एक क्रांतिकारी गठबंधन द्वारा उखाड़ फेंका गया था, जो स्वतंत्र कांगो के पहले प्रधान मंत्री, पैट्रिस लुमुम्बा के प्रशंसक थे। कबिला ने 17 मई, 1997 को ज़ायरा के स्थान पर लुंबा के झंडे को बदलने का आदेश दिया। नई बहाल डिज़ाइन को अब उसके प्रतीक के रूप में प्रशासनिक वास्तविकताओं के अनुरूप नहीं बनाया गया, क्योंकि इसमें छह सितारे थे और देश में आठ प्रांत थे। फिर भी, इसने 1960 में स्वतंत्रता के समय से अपनी मूल आशाओं और सिद्धांतों की बहाली के लिए कांगोलेज़ को याद किया।
2001 में अपने पिता की हत्या के बाद कबीला के पुत्र जोसेफ राष्ट्रपति बने। छोटे कबीला द्वारा देश में स्थिरता लाने का उपाय करने के बाद, उन्होंने 18 फरवरी, 2006 को देश के "थर्ड रिपब्लिक" की घोषणा की। 1963-66 का राष्ट्रीय ध्वज आधिकारिक हो गया, हालांकि क्षेत्र नीले रंग की एक हल्की छाया थी।
